南麂島坐落于浙江溫州平陽縣鰲江口外30海里的東海海面。由大小23個島嶼組成，陸地總面積約12平方公里。因豐富的海洋生物資源，被國務院列為國家級海洋類型自然保護區之一；1998年12月成為我國第一個納入聯合國教科文組織世界生物圈保護網絡的海洋類生物保護區。
面積19600公頃，1989年經平陽縣人民政府批準建立，1990年被批準為國家級，主要保護對象為海洋貝藻類及生態環境。
本區地處臺灣暖流與江浙沿岸流交匯和交替消漲的海區，屬亞熱帶海洋季風氣候。區內海洋生物物種繁多，區系成分復雜，自然生態系統保存良好，生物種類有很多：魚類397種、蝦類79種、蟹類128種，而貝藻品種之齊全居各海域之冠。本區已鑒定的海洋貝類有403種，其中19種為國內首次記錄，海洋底棲藻類有174種，其中黑葉馬尾藻為世界海洋藻類的新種，貝藻類種數約占全國的29% 以上。本區的貝藻類不僅種類豐富，而且還具有溫、熱帶兩種區系特征和地域上的斷裂分布現象，堪稱我國近海貝藻類的一個重要基因庫。
目前這個島上的貝類大約有412種，藻類有174種，其中19種藻類為國內首次發現，22種藻類被列為稀有種。
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